谢谢小秘书邀请，我觉得这个非常适合我回答，下面我详细分析一下，还是一样。在分析之前先下一个结论：俩个都是华东五校，都是非常好的大学都是985.很强，综合实力绝对不相上下，不过具体到学科可以有所不同，不过南京大学的历史更加悠久并且曾经是亚洲最强的大学太牛了，如果不是拆分现在估计还是非常稳健的实力，南京大学是我非常敬佩的大学，当然了交通大学也是很强的大学，现在分析一下。
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在国内的排行榜基本上是清华北大一档，然后是华东五校一档，基本上是清华北大，然后，交大，复旦，南大，浙大，中国科学技术大学，华东五校里面浙大规模最大，上升最快然后交大分数线也非常高，复旦和交大都不相上下，接着就是中国科学技术大学和南大。
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在国际上面的话，南京大学凭借着自己的实力会比交通大学稍微高一点，下面是具体的分析：
上海交通大学源于国立交通大学，底蕴深厚，历史悠久。民国时就已经名扬海内外，
南京大学和上海交通大学的侧重点不同，南大的文理比较优秀，交大的工学和医学比较强势。
在最近英国发布的2019年泰晤士世界大学排行榜中，南京大学位列世界第135名，而上海交通大学则是在190名。
二校虽然一前一后，但在国际上的排名南京大学还是稍高上海交通大学。
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对比一下分数，其实我想说这个分数很多在交通大学在提前批很多都不算做最后的这个统计分数，这个和浙大类似把医学院提前录取然后的话这样结果就是看起来其他的院校分数线更高，不过必须说的是交通大学实力也是很强，而且位居上海，紧随着清华北大，下来就是复旦交大，然后浙大科技大和南大。
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既然回答了还是有必要多说一句：南京大学在1952年院校调整的时候从原来的国立中央大学拆解出来，分成了下面的高校而且各个都很强势真的太不容易了！所以也是我非常佩服的理由下面可以看下：
第一档：4所985、211大学
第一所：由文学院和理学院组建的南京大学（985、211）
南京大学有21个A类学科，其中有3个A+学科：天文学、地质学和图书情报与档案管理。
第二所：由工学院部分院系组建的东南大学（985、211）
东南大学有12个学科进入A类，其中A+的学科5个位列全国第八，江苏第一的位置：建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论。其中交通运输工程、艺术学理论、生物医学工程专业位居全国第一。
第三所：由工学航空系组建的西北工业大学（985、211）
西北工业大学有3个学科进入A类：航空宇航科学与技术为A+档、材料科学与工程为A档、计算机科学与技术为A-档。
第四所：有工学院电子工程系有线电部分组建的电子科技大学（985、211）
电子科技大学有4个学科获评A类学科：电子科学与技术、信息与通信工程2个学科获评A+，计算机科学与技术学科获评A，光学工程学科获评A-。其中电子科学与技术专业全国第一。
第二档：7所211工程大学
第一所：由工学院水利系组建的河海大学（211工程）
河海大学水利工程学科以优异成绩获评A+，其中土木工程和环境科学与工程2个学科位列A类，跻身全国前10%。水利工程专业位居全国第一。
第二所：由师范学院组建的南京师范大学（211工程）
南京师范大学有2个一级学科评为A、4个一级学科评为A-。A：马克思主义理论、教育学；A-：中国语言文学、外国语言文学、地理学、美术学。
第三所：由农学院组建的南京农业大学（211工程）
南京农业大学有4个学科获评A+：作物学、农业资源与环境、植物保护、农林经济管理；公共管理学科评估结果为A,食品科学与工程、园艺学评估结果为A-。南京农业大学全国排名第1的专业：农业资源与环境。
第四所：由工学院食品工程系组建的江南大学（211工程）
江南大学有2个学科获评A+：食品科学与工程、轻工技术与工程位列最高档，设计学位列A-。全国排名第1的专业：食品科学与工程。
第五所：由医学院组建的第四军医大学（211工程）
第四军医大学的临床医学入选A类学科。其中口腔医学学科与北京大学、四川大学口腔医学学科并列进入A+。
第六所：由国立音乐学院组建的中央音乐学院（211工程）
中央音乐学院的音乐与舞蹈学入选A+学科，是全国艺术院校中唯一的一所“211工程”重点建设大学。
第七所：由商学院组建的上海财经大学（211工程）
上海财经大学A类学科有：应用经济学、工商管理、统计学。位居财经类大学之首，力压中南财经政法大学、中央财经大学。
另外还有几所双非大学：南京信息工程大学、江苏大学都是实力非常强的大学，比如南京信息工程大学的大气科学专业的实力无人能出其右。
不拆分将有20个A+学科，并且在各个领域都有非常突出的表现，如农业、音乐、天文，轻工业等方面都是属于顶尖的水平，实力完全可比肩清华。那规模估计武汉的大学城也不能何其相媲美吧！另外浙大之所以这几年发展的如此之后，主要一个原因就是它后期合并了一些大学，尤其是加入和医学院综合实力大增，一直稳居全国第三。而南京大学从被拆分之后，基本都是在原有基础上发展到如今的地步，着实让人佩服。
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上海交通大学。“985”，“211”，双一流国家重点建设工程高校，教育部属，校友会排名第7位，QS全球排名第59位。是一所具有理工特色，理、工、文、医、经、管、法，綜合性全国重点大学之一。国家重点学科49个，授权硕士点298个，博士点203个，博士后流动站28个，国家院士27人，首席科学家36人。学校本科生留学率30%多，世界各国在该校留学生2000多人。学校年资助约150名研究生到全球顶级名校，美国哈佛大学，耶鲁大学，英国牛津大学，剑桥大学，攻读博士学位。是中国一流大学，世界知名，正在向世界一流大学的队伍里冲刺，稳步前进。
南京大学。双一流“985”，“211”重点建设工程高校。校友会排名第8位，QS全球排名122位，也是教育部属，本科，重点综合性大学。国家重点学科，8个。二级重点学科13个。设置专业有86个，授权硕士学位18个。博士学位40个。博士后流动站38个。学校有中科院院士30人，工程院院士3人。其中，化学，物理专业领域是活跃学科，材料科学、地球科学、临床医学均进入全球研究机构排名的前1%，获国家自然科学奖一等奖1项，二等奖12项。和国际名校交流合作办学，美国46所，英国18所，法国22所，德国13所……综上简述，上海交通大学与南京大学綜合实力伯仲之间，各有特点和特长，都是中国重点大学之中的明星院校。
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