菏泽学院在山东省内属于标准的二本高校（按原来的一本、二本、三本进行划分的话），是由原菏泽师专、菏泽教育学院、菏泽电大、菏泽师范、菏泽农校五校合并的，2004年正式升格为本科高校，目前学校没有硕士点，还不是硕士学位授予单位，自然更没有保研的资格。
学校的师资力量一般，高层次人才较少，特别是“江、河、湖、海、山”等具有帽子称号的学者不多，不过教个普通本科生的问题还是不太大的。重点学科、科研平台的实力一般，数量也较少，取得的重大科研成果也不太多，是一所标准的教学型高校。
菏泽学院近些年来一直在谋求硕士点和升格大学两大目标，但是难度都非常大，特别是升格大学这一目标，目前来看还遥遥无期。按照规定，2020年国家将开展新一轮硕士学位单位增列，菏泽学院申报的可能性较大，但成功的可能性不高，主要是山东交通学院、济宁医学院、山东政法学院、潍坊学院、滨州学院、德州学院也都虎视眈眈，都想拿下这个宝贵的名额。通常情况下，只有取得了硕士学位授予权，且有5届以上硕士毕业研究生才有资格申报更名大学（特例不算）。
最后，从菏泽学院2020年在山东省内的录取分数线上来看一下，整体处于公办院校的下游，主要生源的位次在14万至22万名之间。
不过无论怎么说，这也是一所公办高校，比绝大多数的民办高校、独立学院强多了。对于比本科录取分数线高了没有几十分的考生而言，这是一所值得选择的高校。
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