福建医科大学创建于1937年，是我国建校较早的公立本科医学院校之一。2020年，学校荣获第二届全国文明校园称号。
学校是一所以医为主，多学科协调发展，具有完整人才培养体系的福建省“双一流”建设高校，是福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心。
现有上街、台江2个校区，规划占地约1550亩。设有20个学院（部），29个本科专业。现有教职医护员工12800多人（含附属医院），在校全日制学生17000多人。与海内外120多所高校和科研院校开展了多层次、多角度的交流合作。
学校坚持把人才作为发展的第一资源，实施“人才强校”战略。现有专任教师（含临床教师）1627人，其中具有博士学位教师占51.94%，具有高级职称教师占67.73%。
国家级特色专业（4个）：药学、临床医学、基础医学、护理学。
福建省特色专业（8个）：应用心理学、医学检验、社会工作、临床医学、口腔医学、药学、护理学、预防医学。
学校以人才培养为核心任务，坚持立德树人，大力深化教育教学改革。拥有国家级特色专业4个，国家级一流专业建设点9个。
现有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，4个博士后工作站，2个院士工作站。临床医学、药理学与毒理学和化学3个学科进入ESI全球排名前1%，其中临床医学进入ESI全球排名前3‰。
现有血液病学等国家级重点学科（专科）12个，临床医学、基础医学等省级重点学科（专科）56个
学校拥有附属协和医院、附属第一医院、附属第二医院、附属第三医院、附属口腔医院、附属平潭协和医院等6所直属附属医院，编制床位数8500多张。拥有协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、妇儿临床医学院等6所临床医学院。在福建省设有非直属附属医院15所，临床教学医院23所，专业实践教学基地95个。
附属协和医院、附属第一医院和省立医院是福建省首批建设高水平医院，附属医院10个专科医学中心纳入省高水平临床医学中心建设。
附属协和医院、附属第一医院连续7年进入香港艾力彼医院管理研究中心“中国医院竞争力·顶级医院百强榜”。在复旦大学医院管理研究中心发布的排行榜中，附属协和医院、附属第一医院双双进入中国医院百强排行榜；附属医院10个专科进入全国专业声誉排行榜（提名）；43个专科进入华东区医院专科声誉榜（提名）。
附属第一医院滨海院区是国家区域医疗中心，
附属第二医院是福建省南部区域医疗中心领衔医院。
附属口腔医院在口腔疾病诊疗及科研方面全省领先。
附属医院及临床医学院中拥有“国家级住院医师规范化培训基地”16所（全省共22所），附属协和医院入选首批国家临床教学培训示范中心。
中国医院科技量值STEM排行榜中 福建医科大学位居 38位
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